בבוני עולם פועל מערך הכוונה רפואי מקצועי ודיסקרטי, מהגדולים בארץ, המעניק לכל זוג ליווי אישי ומענה פרטני לאורך כל שלבי ההתמודדות. לצד תחום הפוריות עצמו, מעניק הארגון מעטפת רחבה של ייעוץ והכוונה בתחומים רפואיים ומשפחתיים נלווים, בהם גנטיקה, גינקולוגיה, שימור פוריות, עקרות משנית ושלמות הבית.
מערך הייעוץ כולל צוות יועצים רפואיים מקצועיים הפועלים בשיתוף פעולה עם מרכזים רפואיים, בתי חולים ומומחים בארץ ובעולם, במטרה להתאים לכל זוג את המענה המקצועי, המדויק והרגיש ביותר מתוך הבנה שכל מקרה הוא עולם בפני עצמו.
